不及降一级调外用者十七人，年老致仕者十三人，有疾致仕者八人，老疾致仕者九人，贪酷革职者八人，罢软无为冠带闲住者三人，科道拾遗者二十四人。
崇祯二年（1629）三月十八日兵科给事中宋鸣梧疏陈：从来遵化台军营兵、南兵每月一两五钱，北军每月米一石止折银一两，其新设营兵皆折色一两五钱，本色米五斗，有马家丁每月二两三钱五分，无马家丁亦一两一钱，犒赏丰腆，北兵已叹不平，后欠饷日多，诸兵绝望，始离信索饷，各营闻风倡煽。于是东游兵，榆木岭、白羊峪援兵营于二月初三日、初八日集于遵化西门外，伐木立寨，服蟒竖旗，大书「赤心报国，饥军设粮」八字，民起而殴，军起而怒，要索全饷，思得潘中军而甘心焉。至三月二十二日，有司抚定之。次日，巡抚顺天右都御史王应豸以牟饷激变被逮，论死。
崇祯二年（1629）三月，以左副都御史杨鹤总督三边。杨鹤，字修龄，武陵（湖南常德）人。初任佥都御史，因得罪魏忠贤免职。崇祯即位，复官，任左副都御史。关中爆发农民起义，总督缺人，乃拜为兵部尚书，总督讨伐农民军。其时，商洛道参政刘应遇已先击斩王二于白水，又追斩王大梁于汉南。督粮道参议洪承畴也已击破王左桂，义军多被诛灭。杨鹤到任后，督军不利，农民起义军日益增多。
崇祯二年（1629）四月初九日，陕西义军王佐桂攻打耀州（今陕西耀县），督粮道参议洪承畴，率官兵、乡勇万余人，分十二营，围王佐挂于云阳（陕西泾阳），天黑后，雷雨大作，王佐挂乘机突围，走淳化，入道岭。
崇祯二年（1629）四月二十六日马懋才奏：臣乡延安府，去年全年无雨，草木枯焦，民争采山间蓬草为食。蓬草尽，则剥树皮而食。树皮尽，则掘山中石块而食，石性冷而味腥，少食辄饱，不数日则腹胀下坠而死。饥民相聚为「盗」，与其坐等饥死，不如为「盗」而死。又烧人骨为薪，煮人肉以为食者，而食人之人，不数日即面目赤肿，燥热而死。于是，死枕藉，臭气薰天，安塞县城外掘数坑，每坑可容数百人，不及掩埋者，又不知还有多少？小县如此，大县可知，一处如此，他处可知。百姓又安得不相牵而为「盗」。而庆阳、延安以北，饥荒更甚。
起义首领王二、王大梁虽先后牺牲，但继起者日众。崇祯二年（1629）闰四月初八日，起义军七千余人攻三水，游击高从龙败死。官兵被伤者二千余人。
崇祯二年（1629）五月，日食。崇祯帝因旧历法推算日食失验，欲加罪台官。礼部尚书徐光启上言：「台官测候，本郭守敬法，元时尝当食不食，无怪今日之失，宜及时修治，参用西法。」崇祯帝从之，诏外国人龙华民等编修新历法，徐光启为监督。西历自此开始实行。
六月袁崇焕斩杀毛文龙（？－1629）仁和（今杭州）人，镇守东江。其人无大略，所战皆败，又假称捷冒功，纵容部下淫掠。袁崇焕到任后，上疏请派部臣清理东江军饷，文龙则抗疏驳之，袁崇焕决心除掉毛文龙。崇祯二年（1629）六月初五日，袁以阅兵为名至双岛，邀其观将士射。先设帐于山下，令参将谢尚政等伏于帐外。文龙至，崇焕责问文龙违令数事，文龙抗辩，崇焕厉声叱之，并命去掉冠带絷缚，崇焕历数文龙十二大罪状，文龙丧胆，叩首乞免，袁崇焕遂取尚方剑斩之帐前。
崇祯元年（1628）六月，崇祯帝起用朱燮元，复其故官，兼抚贵州。朱燮元征发云南兵攻下乌撤；四川兵出永宁，攻下毕节；自率兵驻陆广。水西兵安邦彦与奢崇明来攻，燮元令贵州总兵许成名率兵佯退诱敌，另派兵三路捣其老巢，四川总兵候良柱，副使刘可训与敌战于永宁，后与成名合击，大破水西兵。崇祯二年八月初十日，斩邦彦，崇明，俘敌数千人。后来燮元又迫降安位，水西、永宁皆平。
崇祯二年（1629）十月二十七日，后金兵分三路，一路攻打入大安口，参将周镇死亡；一路攻入龙井关，一路攻打洪山口，明参将张安德等败逃，张万春降。蓟州被围，十一月，京师戒严。
崇祯二年（1629）十一月，后金皇太极亲自督军攻入龙井关，以蒙古喀尔沁台吉布尔噶图为向导，攻克洪山口。别将攻克大安口，会于遵化。本月初四日，山海关总兵赵率教入援，于遵化战死，全军覆没。巡抚王元雅、保定推官李献明、永平推官何天球、遵化知县徐泽、前任知县武起潜等，据城拒守，城破皆死。
十二月四日，崇祯帝下崇焕于狱，激起祖大寿之变，承宗力为抚定。后金兵退，加承宗太傅，力辞不受
崇祯二年（1629）十二月，宣大总督及宣府、保定、河南、山东、山西巡抚，闻京城戒严，都奏请率师入卫。山西巡抚耿如杞与总兵张鸿功也率五千人赴援。军队曾有令曰：「卒至之明日，汛地既定而后给饷。」山西援兵既至，今日令守通州，明日调昌平，后日又调良乡。驻地累更，三日没有给军饷，军队乃发生哗变。事发后，耿如杞、张鸿功被捕入狱。时四方援兵先后集，以缺饷故，多肆剽掠。
崇祯二年（1630）十二月初四日，成都地震，声吼如雷，连震十二次，房动屋摇，鸡鸣大吠，河涨水赤，山崩城倒，压死宿城楼营兵数名。松潘卫（今松潘）日震十二次，声如雷。小河营（即小河守御千户所）同日震，山崩，城塌一百二十丈，压死军民数人。同日重庆府、壁山、广安州、苍溪、珙县、威远等俱震。震中烈度（Io）VIII，震级（M）为六点二五级。
后金兵自通州东行，攻克香河，进逼永平。崇祯三年（1630）正月初四日，黎明，城破，副使郑国昌自缢于城上。知府张凤等皆死。接着陷滦州，知州杨濂自刎，太仆寺卿冯运泰先遁。再攻抚宁，参将黄维正力守，四日不克。转攻昌黎，还永平。
崇祯三年（1630）一月初九日，后金兵攻下滦州后，分兵自抚宁向山海，离关三十里列三营。山海北路副总兵官惟贤与参将陈维翰设两营拒敌。后惟贤奉马世龙命，率陈维翰及游击张化等往袭遵化。城中兵出击，惟贤军先锋死战，后队乘势进攻，城上矢石如雨。惟贤、张化皆战死，士卒死伤三百余人。
崇祯三年（1630）一月二十二日，后金乘胜进攻马兰城。时副总兵金日观驻守马兰。金日观坚守马兰城，亲燃大炮。头目手足皆被烧，而意气犹盛。后马世龙令参将王世选等赴救，后金兵退。寻，又以二千骑来攻马兰，金日观与王世选等死守不下。
崇祯二年由庶吉士升为兵部右侍郎的刘之纶。毅然请战，召募万人，分为八营，以副总兵八人分将之。后金兵攻下滦州，驻三屯营，分兵守汉儿庄。刘之纶出蓟州（天津蓟县），派别将吴应龙等从中路取罗文峪关，自率八营兵抵遵化。后金兵闻报，于三屯营派精兵三万攻之，刘之纶兵大败。后金兵围山，招刘之纶降，左右劝其结阵徐退，刘之纶拒绝，整军再战，崇祯三年正月二十二日为后金兵射杀，八营兵只剩一营。
崇祯三年（1630）三月十七日，工部尚书南居益题开纳事例。接着南直隶巡按王道直解苏、松、常、镇四府道州县等官及乡缙典户所捐银九千八百三十八两充饷，至四月初四日，南居益等率属助饷。崇祯帝优旨核收。从此开捐资助饷之端。
崇祯三年（1630）三月二十七日，南京户科给事中陈尧言疏陈：南京户部设有新旧二厂。旧厂铸钱搭放军粮兼支官俸，新厂铸钱起自泰昌元年（1620），原动南本鼓铸南钱，以佐旧厂之不足，一岁之间除军粮商价外，仍以余利解助辽饷。至天启二年（1622），始用北本改铸北钱，
